براى اجراى حكم الهى قصاص، به تهران (دار الحكومۀ وقت) رهسپار شدند و بر اجراى عدالت اصرار ورزيدند تا قاتل قصاص شد.

به اين ترتيب امام خمينى از اوان كودكى با رنج يتيمى آشنا و با مفهوم شهادت رو به رو شد. وى دوران كودكى و نوجوانى را تحت سرپرستى مادر مؤمنه‌اش (بانو هاجر) كه خود از خاندان علم و تقوا و از نوادگان مرحوم آيت‌الله خوانسارى (صاحب زبده التصانيف) بوده است. همچنين نزد عمۀ مكرمه اش (صاحبه خانم) كه بانويى شجاع و حقجو بود، سپرى كرد، اما در سن 15 سالگى از نعمت وجود آن دو عزيز نيز محروم شد.

امام خمينى با بهره‌ورى از استعداد فوق‌العاده، رشته‌هاى مختلف علوم را به سرعت طى كرد. علاوه بر فقه و اصول و فلسفه، عرفان را نيز در عالى‌ترين سطح نزد استادان برجستۀ آن زمان در خمين، اراك و قم طى كرد و در مدت 6 سال جهش فوق‌العاده‌اى داشت حتى اسفار را پشت سر گذاشت و از فضلا و شخصيت‌هاى برجستۀ حوزه علميۀ قم به شمار مى‌آمد. امام خمينى در طول حيات گرانقدرش آثار فراوانى را نگاشته و به يادگار گذاشته است كه در زير به آنها اشاره مى‌شود:

1 - شرح دعاى سحر:

شرح دعاى سحر اولين تاليف حضرت امام است كه نگارش آن به سال 1347 ه‌ - ق بر مى‌گردد، اين كتاب كه به زبان عربى است در تفسير و توضيح دعاى سحر نوشته‌شده و امام اشارات متعددى به نظرات استاد خود مرحوم آيت‌الله شاه‌آبادى كرده‌اند. كتاب حاضر پس از اصلاح و مقابله با نسخه‌هاى موجود، همراه با توضيحات و فهرست اصطلاحات، آيات، روايات و...

توسط موسسۀ تنظيم و نشر آثار امام خمينى به زيور طبع آراسته و تقديم علاقه‌مندان شده است. (لازم به ذكر است كه اين كتاب به وسيلۀ آقاى سيد احمد فهرى ترجمه‌شده است كه توسط نهضت زنان مسلمان به چاپ رسيده است).

2 - شرح حديث رأس الجالوت:

شرح امام خمينى (ره) بر حديث رأس الجالوت (احتجاجات حضرت امام رضا (ع) با اصحاب اديان مختلفه و از آن جمله رأس الجالوت از علماى يهود) كه به سال 1348 هجرى قمرى تأليف شده است اين حديث در توحيد و نيز عيون اخبار الرضا شيخ صدوق و احتجاج طبرسى و جلد دهم بحارالانوار و جلد دوم مسند الرضا نقل‌شده است؛

3 - حاشيۀ امام بر شرح حديث رأس الجالوت:

علاوه بر شرح مستقل امام بر حديث مزبور، آن حضرت تعليقهاى نيز بر شرح مرحوم قاضى سعيد محمد بن محمد مفيد قمى از دانشمندان و عرفاى سده يازدهم، بر حديث رأس الجالوت نيز نوشته‌اند؛

4 - التعليقه على الفوائد الرضويه:

اين كتاب تعليقۀ امام خمينى (ره) بر شرح فلسفى، عرفانى حديث (رأس الجالوت) از قاضى سعيد قمى است؛

5 - شرح حديث جنود عقل و جهل:

كتاب شريف «شرح حديث جنود عقل و جهل» كتابى عرفانى - اخلاقى مشتمل بر مباحث ارزشمند عرفان نظرى - فلسفه اسلامى - اخلاق، شرح احاديث، انسان‌شناسى، تفسير همراه با نصايح اخلاقى است؛

6 - مصباح الهدايه الى الخلافه و الولايه: