مسائل عرفانى كه همراه با رسالۀ لقاء الله آيت الله حاج ميرزا جواد ملكى تبريزى به چاپ رسيده است؛

12 - حاشيه بر اسفار:

حضرت امام سال‌ها در قم كتاب گرانقدر «اسفار اربعه» تأليف فيلسوف شهير صدر المتألهين را تدريس كرده‌اند و بر مباحثى از آن حاشيه نوشته‌اند. اميد است آراى فلسفى حضرت امام نيز جهت بهره‌بردارى جامعه اسلامى تنظيم و منتشر شود؛

13 - كشف الاسرار:

كتاب فوق كه اثرى است سياسى، عقيدتى و اجتماعى در سال 1323 هجرى شمسى يعنى دو سال پس از عزل رضاخان از سلطنت نوشته‌شده است. در اين اثر امام به شبهات و تبليغات ضد دينى و ضد روحانى جزوه «اسرار هزار ساله» يك وهابى گرا پاسخ گفته و به استناد حقايق تاريخى و ضمن طرح و نقد آراى فلاسفۀ يونان قديم، فلاسفۀ اسلام و فلاسفۀ معاصر غرب، بر حقانيت تشيع و نقش سازنده روحانيت اسلام تأكيد ورزيده است. در همين كتاب انديشۀ حكومت اسلامى و ولايت‌فقيه در عصر غيبت مطرح‌شده است و به تفصيل سياست‌هاى ضد ملى و لاييك رضاخان و همفكران او در ممالك اسلامى (در آن زمان) افشا شده‌اند؛

14 - انوار الهدايه فى التعليقه على الكفايه (2 جلد):

اين اثر گرانسنگ، حاشيه‌اى است مبسوط از آثار قلمى حضرت امام خمينى (ره) كه به خط مبارك ايشان بر مباحث عقليۀ كتاب (كفايه الاصول) محقق بزرگ، آيت‌الله آخوند خراسانى تحرير شده است. كتاب (انوار الهدايه) به عنوان يك اثر اصولى نفيس به همراه استخراج ها و زندگينامۀ كوتاه رجال ذكر شده در آن، و نيز شرح اصطلاحات و فهرست‌هاى گوناگون، با روشى تحقيقى و علمى، در دو جلد به زيور طبع آراسته شده است؛

15 - بدايع الدرر فى قاعده نفى الضرر:

رساله‌اى تحقيقى، اجتهادى به زبان عربى در بحث «قاعده لاضرر» كه از قواعد مهم فقهى است. امام اين رساله را در جمادى‌الاولى سال 1368 هجرى قمرى تأليف كرده است. اين رساله به همراه تعدادى ديگر از رساله‌هاى اصولى امام در مجموعه‌اى تحت عنوان «الرسائل» در سال 1385 هجرى قمرى در قم به چاپ رسيده است؛

16 - الرسائل العشره:

اين كتاب شامل ده رسالۀ عملى به زبان عربى است اين رساله‌ها عبارتند از: تقيه، فروع علم اجمالى، قاعده من ملك، تداخل الاسباب، قياس العلل التشريعيه بالتكوينيه، موضوع علم اصول، الفجر فى الليالى المقمره، العقود و الايقاعات، الشرط المخالف الكتاب، قاعده على اليد؛

17 - رساله الاستصحاب:

مبحث استصحاب يكى از مباحث عمده علم اصول فقه به شمار مى‌رود، حضرت امام در دوره درس اصول خود به اين بحث نيز پرداخته‌اند و اين كتاب حاصل دروس ايشان است كه به رشتۀ تحرير درآمده است؛

18 - رساله فى التعادل و التراجيح:

حضرت امام اين رساله را در سال 1370 قمرى تأليف كرده است. تعادل و تراجيح از مباحث تكميلى علم اصول فقه است كه در آن معيارهاى انتخاب دليل