ايشان برتمام جوانب درس، موشكافى‌ها و تحقيق‌هاى ارزنده و رو به رو شدن با مبانى مُتقن فقهى و اصولى ايشان، انگشت حيرت به دهان گرفته، خودرا سرزنش كردند. [1]

با شروع اين درس، تحوّلى در حوزه نجف رخ داد و زمينه گرايش بيشتر طلبه‌ها و فضلا را براى شركت در آن فراهم كرد و طولى نكشيد كه حوزه درسى امام قدس سره به‌عنوان يكى از برجسته‌ترين حوزه‌هاى درسى نجف از لحاظ كميت و كيفيت شناخته شد. يكى از شاگردان حضرت امام قدس سره در وصف اين حوزه درسى مى‌نويسد:

امام درس رسمى خود را ... آغاز كرد و درهاى تازه‌اى از ژرفاى دانش خود را بر روى دانش‌پژوهان حوزه نجف گشود و مطالب ارزنده و ناشنيده‌اى به حوزه علميه نجف عرضه كرد كه بسيارى از علماى فارغ‌التحصيل و بى‌نياز از تحصيل را به شگفتى واداشت و بهت‌زده كرد، تا آنجا كه بعضى از مقامات برجسته روحانى آنگاه كه در حوزه درس امام حضور يافتند، صريحاً اعتراف كردند: ما پيش از آمدن آيةالله خمينى به نجف اشرف باور نمى‌كرديم كه در دنياى علوم اسلامى حرف تازه‌اى باشد كه ما نشنيده باشيم، ولى آنگاه كه ايشان به نجف اشرف منتقل شدند و درس شروع فرمودند، دريافتيم كه خيلى مطالب علمى و پرارزش است كه ما نشنيده‌ايم، و نيز پيش از تشريف فرمايى ايشان به نجف اشرف ما خود را فارغ‌التحصيل پنداشته، گمان مى‌كرديم كه از تحصيل بى‌نيازيم. ليكن وقتى در محضر درس آيةالله خمينى حاضر شديم فهميديم كه هنوز بايد درس بخوانيم. [2]

مباحث حوزه درسى امام قدس سره در نجف عبارتند از: خارج بيع و خيارات و نيز خلل واقع در نماز، كه چاپ و انتشار «كتاب‌البيع» و «كتاب الخلل فى‌الصلاة» ثمره آن درس‌ها است. بعلاوه، در همين حوزه بود كه امام راحل قدس سره براى نخستين بار مبانى نظرى حكومت اسلامى را تحت عنوان «ولايت فقيه» بيان كرد و از عرصه منبر نجف، جوّ مسموم و خوابزده آن حوزه و جامعه روحانيت شيعه را به حمله گرفت، با نگهبانان‌

[1] - پا به پاى آفتاب، ج 3، ص 36

[2] - بررسى و تحليلى از نهضت امام خمينى، ج 2، ص 174